Pesut Mahakam adalah salah satu lumba-lumba
sehingga tidak dikategorikan sebagai ikan melainkan mamalia.
Pesut mahakam melahirkan dan menyusui anaknya, sementara ikan berkembang biak dengan bertelur dan anaknya menetas di luar. Pesut mahakam bernafas dengan paru-paru, sedangkan ikan bernafas dengan insang. Karena bernafas dengan paru-paru maka secara periodik pesut mahakam akan muncul ke permukaan air untuk menghirup udara (O2) dan mengeluarkan zat asam arang (CO2).
Untuk bernafas, pada bagian belakang kepala pesut mahakam terdapat lubang nafas untuk mengeluarkan CO2. Dari segi penampakan fisik, yang membedakan pesut mahakam dengan ikan adalah kedudukan sirip ekornya; kedudukan sirip ekor mamalia air horizontal, sementara sirip ekor ikan vertikal